Ten wyjątkowy w województwie warmińsko-mazurskim ośrodek posiada dobrze wyposażoną bazę, na która składają się: trzy sale ze sprzętem multimedialnym, stanowiska komputerowe z dostępem do Internetu, sprzęt  do obserwacji mikro- i stereoskopowych, walizkowe laboratoria do badania jakości, gleby i powietrza, wideoteka i biblioteka, Muzeum Jeziora z akwariami i planszami. CEE podejmuje bogatą działalność obejmująca: zajęcia dydaktyczno-wychowawcze prowadzone przez nauczycieli, warsztaty, sympozja, konkursy, konferencje, wystawy, przygotowanie wydawnictw, zajęcia na terenie ogrodu botanicznego Centrum, imprezy okolicznościowe dla dzieci, młodzieży i dorosłych..

     Projekt jest inicjatywą przedstawicieli społeczności lokalnej, która uzyskała aprobatę i wsparcie ze strony samorządu. CEE współpracuje nie tylko ze szkołami, do których kieruje znaczną część swojej oferty, ale i z innymi partnerami, w tym pozarządowymi, w samym Ełku i okolicy. Koszt funkcjonowania obiektu dydaktycznego CEE w 2007 roku wyniósł ok. 250 tys. zł.